เดิมหลักสูตรบริหารธุรกิจมหาบัณฑิต ได้บรรจุแผนการพัฒนาการศึกษาระดับอุดมศึกษาระยะที่ ๘ ของคณะศึกษาศาสตร์ การจัดการศึกษาหลักสูตรบริหารธุรกิจมหาบัณฑิตมีวัตถุประสงค์เพื่อผลิตมหาบัณฑิตสำหรับผู้บริหาร มหาวิทยาลัยบูรพา จึงได้เสนอสภามหาวิทยาลัยบูรพา เมื่อคราวประชุมครั้งที่ ๔/๒๕๓๘ เมื่อวันที่ ๒๔ สิงหาคม ๒๕๓๘ ขอปรับแผนฯ ปี ๒๕๓๘ จากหลักสูตรบริหารธุรกิจมหาบัณฑิต เป็นหลักสูตรบริหารธุรกิจมหาบัณฑิต สำหรับผู้บริหาร และได้จัดตั้งหน่วยงานขึ้นมาบริหารหลักสูตรนี้เรียกว่า โครงการปริญญาโทสาขาบริหารธุรกิจ สำหรับผู้บริหาร โดยในระยะเริ่มต้นให้มีการยืมเงินของมหาวิทยาลัยบูรพามาลงทุนก่อน จนกระทั่งโครงการปริญญาโทสาขาวิชาบริหารธุรกิจ สำหรับผู้บริหารดำเนินการได้แล้ว ได้ใช้เงินยืมคืนให้กับมหาวิทยาลัยบูรพาแล้ว ซึ่งมหาวิทยาลัยก็ได้เห็นชอบจากทบวงมหาวิทยาลัยเมื่อวันที่ ๑๔ ธันวาคม ๒๕๓๘ โครงการปริญญาโทสาขาวิชาบริหารธุรกิจสำหรับผู้บริหาร ได้รับการจัดตั้งเป็นหน่วยงานภายในมหาวิทยาลัยบูรพาโดยใช้ชื่อ “วิทยาลัยพาณิชยศาสตร์”
