รศ.สมชาย เดชะพรหมพันธุ์
ผู้อำนวยการ (พฤศจิกายน ๒๕๓๗ – ตุลาคม ๒๕๔๑)
นายวิทยา ศรียุทธนา
ผู้อำนวยการ (มกราคม ๒๕๔๒ – ธันวาคม ๒๕๔๕
ผศ.ดร.รัชนีภรณ์ ทรัพย์กรานนท์
ผู้อำนวยการ (มกราคม ๒๕๔๖ – ธันวาคม ๒๕๔๙)
ผศ.ดร.ฉันทนา จันทวงศ์
ผู้อำนวยการ (ธันวาคม ๒๕๔๙ – ธันวาคม ๒๕๕๓)
รศ.เทพศักดิ์ ทองนพคุณ
ผู้อำนวยการ (ธันวาคม ๒๕๕๓ – พฤษภาคม ๒๕๕๕)
ผศ.ดร.เกรียงศักดิ์ พราหมณพันธุ์
ผู้อำนวยการ (มิถุนายน ๒๕๕๕ – พฤษภาคม ๒๕๖๓)
ผู้รักษาการแทนหัวหน้าศูนย์ประเมินผลกระทบสิ่งแวดล้อม
(ตุลาคม ๒๕๖๒ – พฤษภาคม ๒๕๖๓)
พีรพัฒน์ มั่งคั่ง
ผู้อำนวยการสำนักบริการวิชาการ
(มิถุนายน ๒๕๖๓)